Fundamilenio nace en 1997 en Apartadó como una entidad autónoma de participación democrática, sin ánimo de lucro, con experiencia en las áreas de educación, cultura, salud ocupacional, vivienda digna, turismo y cohesión social, a través del trabajo con niños, jóvenes, mujeres, adultos mayores y población víctima de la violencia.

La Fundación está comprometida en servir a la comunidad trabajadora y sus familias, a través de planes, programas y proyectos sociales para generar nuevas alternativas que permitan mejorar su calidad de vida; la promoción de procesos participativos de los trabajadores afiliados al agro y la creación de una conciencia ciudadana entorno a la construcción de tejido social, paz y ciudadanía.